为什么机械分群结果中有的细胞会离群?
2024-10-08 14:38:47
# easy
单细胞数据机械分群时常会出现的问题之一,在算法上聚为一群的细胞,在UMAP图中的位置却非常分散,如下图,cluster2的部分细胞混杂在cluster7,cluster0中。
这种现象或可从降维的角度理解,虽然在二维平面看来cluster2的部分细胞混杂在cluster7,cluster0中,但在高维上cluster2的细胞是距离较近的一个整体。
比如将天空中的每朵云看作一个细胞群,虽然我们抬头看时,云朵层层叠叠,互相混杂,但每朵云的真实距离其实可能很远。